Kotori

Po walce ze zmartwychwstałym naukowcem Ochiaiem siły Sidonii przypuszczają atak na kolosalny statek klasterowy. Jednak w wyniku zasadzki pustelniaków druga flota ponosi ogromne straty, a Tsumugi musi walczyć o życie. Tymczasem nadciągają armady pomniejszych statków klasterowych. Nagate pozostawia Norio Kunato obronę Sidonii, zaś sam zasiada za...

Prace nad emiterem grawitonów Toha Heavy Industries zostają ukończone, a wojna z pustelniakami wchodzi w ostatnią fazę. Lecz zanim siły Sidonii zmierzą się z Kolosalnym Statkiem Klasterowym, będą musiały stawić czoła odrodzonemu po stu latach Ochiaiowi, który zawładnął świadomością śmiertelnie niebezpiecznej hybrydy....

Siły Sidonii przygotowują się do decydującej bitwy z kolosalnym statkiem klasterowym, równocześnie odpierając kolejne, coraz bardziej przebiegłe ataki pustelniaków.Tymczasem na pokładzie statku-arki czai się równie wielkie niebezpieczeństwo…...

Po udanej akcji ratunkowej Teruru Ichigayi i bliskim spotkaniu z kolosalnym statkiem klasterowym, Nagate i jego towarzysze wyruszają na kolejną misję. Tym razem czeka ich długa i wyczerpująca podróż na pokładzie nowego krążownika wprost do wnętrza gwiazdy Lem, gdzie mają za zadanie dostarczyć tajemniczy ładunek. Czy pozbawiona wsparcia Sidonii...

Test nowego systemu rozpoznania ujawnia, że na powierzchni planety Siedem przebywa członkini grupy kolonistów ocalała z ataku pustelniaków. Nagate i Izana wyruszają na ryzykowną misję ratunkową, aby odnaleźć kobietę nim zrobi to czyhający w morskich głębinach pustelniak....

Po kolejnym zwycięstwie nad Pustelniakami, przychodzi czas na odrobinę odpoczynku dla załogi Sidonii. Jednak podczas gdy Nagate wraz z przyjaciółmi cieszy się chwilą wytchnienia od wojennej codzienności, Ochiai podejmuje próbę spełnienia swojego marzenia. A to może oznaczać zagładę całego statku....